A propos Pr C. Siatka

Directeur général, généticien

SARS-CoV-2 et recherche

 

 

SHL Stories and Media archive for Tag: COVID-19

How NETs harm lungs

Are NETs present in human ARDS, like during fulminant coronavirus infections? Could breaking up NETs help cure patients? 

How NETs harm lungs

4/23/2020

COVID-19 et SARS-CoV-2

L’Ecole de l’ADN, Centre d’Innovation en Génétique et Biotechnologie est mobilisée pour faire face à l’épidémie de COVID-19:

Le Président de l’Ecole de l’ADN, Philippe Berta est nommé à la tête d’un groupe de travail sur le recherche sur le COVID-19.

 

 

 

Articles de revue publiés dans Salles Propres:Publié le 19 mars 2020 : État de l’Art sur la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)

Publié le 8 avril 2020 : Le virus SARS-CoV-2 et la maladie COVID-19 : données moléculaires

Article de revue publié par Horiba Diagnostic:

Utilisation de marqueurs biologiques pour le diagnostic et la surveillance du COVID-19

 

 

Le virus SARS-CoV-2 et la maladie COVID-19 : données moléculaires

Le virus SARS-CoV-2 et la maladie COVID-19 : données moléculaires

Philippe Berta1,2 et Christian Siatka 1,2

      1Université de Nîmes, site des Carmes, place Gabriel Péri, 30021 Nîmes – France

         2Ecole de l’ADN de Nîmes, Muséum d’Histoire Naturelle, 30000 Nîmes – France

article publié le 15 avril 2020 dans

Comprendre les mécanismes moléculaires utilisés par le virus permettra de dégager des stratégies de diagnostic, de prise en charge et de traitement efficace des patients symptomatiques mais aussi asymptomatiques. Après avoir proposé un point complet sur le virus SRAS-Cov-2 le 19 mars 2020, Christian Siatka de l’Ecole de l’ADN de Nîmes et Philippe Berta de l’Université de Nîmes apportent aujourd’hui un éclairage sur les données moléculaires.

Merci à Mme Béatrice Becherini, Rédactrice en chef, du magazine Salles Propres pour sa collaboration.

Article  en téléchargement

PDB:6VYB

 

Utilisation de marqueurs biologiques pour le diagnostic et la surveillance du COVID-19

COVID-19 screening, prognosis and severity assessment with biomarkers
for management of patients

Published April 10, 2020

COVID-19 Article HORIBA

Summary
This global epidemic of coronavirus that we are currently experiencing, need an over view on the biological markers that allow the monitoring of COVID-19 disease. After a synopsis of the clinical characteristics and the management of patients, we propose a literature review of the diagnostic tests which include molecular and serological diagnosis. The aim of this document is to show the biological markers involved in screening, triage and prognosis, which involves white blood cells, platelets, Ddimer, CRP and fibrinogen. While acknowledging that these parameters are not exhaustive, they nonetheless represent essential biological markers for the management of this epidemic.

Cette épidémie mondiale de coronavirus que nous connaissons actuellement a besoin d’une vue d’ensemble sur les marqueurs biologiques qui permettent la surveillance de la maladie COVID-19. Après un synopsis des caractéristiques cliniques et de la prise en charge des patients, nous proposons une revue de la littérature des tests diagnostiques incluant le diagnostic moléculaire et sérologique. Le but de ce document est de montrer les marqueurs biologiques impliqués dans le dépistage, le triage et le pronostic, qui impliquent les globules blancs, les plaquettes, les D-Dimer, la CRP et le fibrinogène. Tout en reconnaissant que ces paramètres ne sont pas exhaustifs, ils représentent néanmoins des marqueurs biologiques essentiels pour la gestion de cette épidémie.

Christian Siatka(1,2), Marion Eveillard(3), Jun Nishimura(4), Christophe Duroux(5) and George Ferrandi (5,6)

1 Université de Nîmes, 7 Place Gabriel Péri, 30000 Nîmes – France
2 Ecole de l’ADN de Nîmes, Muséum d’Histoire Naturelle, 30000 Nîmes – France
3 CHU de Nantes, service d’hémathologie biologique, 9 quai Moncousu, 44093 Nantes-Cedex 1- France
4 HORIBA, Ltd. 2 Miyanohigashi, Kisshoin, Minami-ku, Kyoto 601-8510 – Japan
5 HORIBA ABX, Parc Euromédecine, Rue du Caducée – BP 7290, 34184 Montpellier-Cedex 4 France
6 Lead contact

Le Président de l’Ecole de l’ADN, Philippe Berta, nommé à la tête d’un groupe de travail sur le recherche sur le COVID-19

COVID-19, c’est le Président et fondateur de l’Ecole de l’ADN qui est nommé à la tête d’un groupe de travail sur le COVID-19 à l’Assemblée Nationale

Source “Objectif Gard”

(Photo Norman Jardin)

Le Pr Philippe Berta, généticien Président de L’Ecole de l’ADN est Professeur à l’Université de Nîmes

« Toute la communauté de la recherche est fortement mobilisée pour une meilleure compréhension du virus et la recherche de traitements. Des financements exceptionnels ont été débloqués. Des essais cliniques sont en cours. Nous travaillons dès à présent au suivi de ces travaux, à leur accompagnement et à leur facilitation », déclare le député Philippe Berta.

La commission des Affaires culturelles et de l’éducation de l’Assemblée nationale a nommé, ce mercredi 8 avril, le Professeur Philippe Berta président du groupe de travail sur la recherche sur le COVID-19

 

Formation sur le diagnostic moléculaire de COVID-19 : Détection et quantification du SRAS-CoV-2

https://encrypted-tbn0.gstatic.com/images?q=tbn%3AANd9GcTqpkEOI23YpFXV45OoE3VEEVfliguO4ipyoV1jeGkGJQeZIF7-&usqp=CAUContexte            

Depuis décembre 2019 nous sommes confrontés à une épidémie mondiale liée à un virus à ARN de la famille des Coronavirus, qui induit un syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS). Cet agent pathogène jusque-là inconnu est appelé «Coronavirus associé au SRAS» (SRAS-CoV). L’OMS a officiellement nommé la maladie du coronavirus 2019 (COVID-19) et le groupe de travail international sur le Coronavirus (Coronavirus Study Group-CSG) propose de nommer ce nouveau coronavirus SARS-CoV-2 (en français SRAS-CoV-2), ces deux dénominations ont été publiées le 11 février 2020[1].

Formation sur le diagnostic moléculaire de COVID-19 :  détection et quantification du SRAS-CoV-2

 Pour faire face à la demande croissante de diagnostic moléculaire du COVID-19 par la détection du SARS-CoV-2 par PCR quantitative (qPCR) ou real-time PCR (RT-PCR), l’École de l’ADN centre de formation spécialisé en détection et quantification génomique par PCR quantitative propose une formation qualifiante sur le diagnostic moléculaire du COVID-19.

La formation sur 2 jours (15h) a pour objet de rendre opérationnels et autonomes tous les personnels des laboratoires d’analyses médicales, santé humaine ou animale ou autres, qui doivent mettre en œuvre le diagnostic moléculaire du COVID-19. La formation est réalisée conformément aux normes ISO 15189 ou 17025.

Contenu de la formation

–     Explication des acronymes : qPCR, RT-qPCR, RT-PCR,

  • Rappels règlementaires sur les règles de manipulation en laboratoire de confinement L2,
  • Les dispositifs médicaux de diagnostic COVID-19 marqués CE disponibles au jour de la formation,

–     Gestion de l’échantillon biologique, échantillonnage multi support pour la détection et la quantification

  • Le principe de la PCR quantitative,
  • Extraction d’ARN,
  • Rétrotranscription et amplification,
  • Les recommandations CE de la qPCR en diagnostic moléculaire,
  • Mise en œuvre de la qPCR (préparation et gestions des réactifs),
  • Validation de méthodes,
  • Interprétation et rendu des résultats,

Notes

  • Au cours de la formation, aucun produit biologique humain n’est manipulé
  • La formation est réalisée sur des dispositifs médicaux marqués CE (selon la directive européenne 98/79/CE), voir liste en annexe : « Coronavirus (COVID-19) » en date du 29/03/20

[1] «Etat de l’Art sur maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) », Siatka C, 19 mars 2020, Salles Propres (Edition en ligne)

Etat de l’Art sur la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)

Etat de l’Art sur la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)

Christian Siatka, Université de Nîmes, Directeur de l’Ecole de l’ADN

Compte tenu de cette crise sanitaire unique dans notre histoire et des dispositions qui ont été mises en place à l’échelle internationale de confinement et de lutte contre cette épidémie de coronavirus 2019, il apparaît important de faire un point complet à ce jour sur les connaissances de SRAS-Cov-2, ce virus nouveau.

ARTICLE COMPLET EN LIGNE dans le MAGAZINE SALLES PROPRES

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SEMAINE DU CERVEAU 2020

L’Ecole de l’ADN en partenariat avec L’université de Nîmes organisent et pilotent la semaine du cerveau sur Nîmes

Contact : patrizia. giannoni@gmail.com – christian.siatka@unimes.fr

 

16 mars 2020,

18H-19H00, Site des Carmes, Amphi

  • A1« Psychologie du souvenir : le vrai du faux »
  • (Dr Fabrice Guillaume, PR en Psychologie, Université d’Aix-Marseille)

Cette petite psychologie du souvenir visera à préciser le fonctionnement de notre mémoire et les mécanismes d’accès aux souvenirs. Les recherches de ces trente dernières années ont permis des avancées considérables dans notre compréhension des faux souvenirs, de l’oubli ou du déjà-vu. Nous aborderons l’importance de ces découvertes dans le cadre des fonctionnements atypiques comme les états de stress post-traumatique, l’hypermnésie ou la dépression.

 

18 mars,

18H-19H00, Site des Carmes, Amphi A1

  • «  Usages et Utilités sociales d’une Recherche sur le Cerveau : Un traitement Possible d’une Dépendance à l’Anorexie, et de la Suralimentation. »
  • (Valérie Compan, professeur des Universités, BRAINS’Laboratory_LSCO, BRAINS’Laboratory S.A.S.  https://brains4d.com)

Comment le cerveau maintient-il une décision inappropriée de ne pas manger, comme de consommer des drogues (e.g. cannabis, ecstasie, cocaïne) au point de mourir, alors qu’il a évolué pour survivre en favorisant une conduite alimentaire adaptée et adaptative? Ce mystère constitue un défi vital pour mieux connaître les bases neurales de décisions inappropriées (vraisemblablement en appui d’anomalies de la plasticité neuronale : inconscience) ; et, pour faciliter l’identification de solutions thérapeutiques. Nos études portent sur deux structures du cerveau (noyau accumbens, cortex préfrontal) et impliquées dans une décision guidée par l’attente de récompenses et, visent à identifier des causes de l’addiction aux drogues et d’autres dépendances comme l’anorexie. En utilisant des techniques modernes, de nouveaux modèles animaux, incluant d’autres parts des sciences, nous illustrerons comment les dépendances modifient jusqu’à la morphologie des neurones du système de la récompense. Après deux décennies d’activités de recherche, nos résultats sont applicables à l’humain.

Formations e-newsletter mensuelle

le lien direct de la news lettre

 

Bonjour,
“Je souhaite partager un coup de coeur pour le livre de Marc-André Selosse, “Goûts et couleurs du monde”.
Après “Jamais seul”, qui nous a fait découvrir le monde des microbes et leurs associations avec les plantes et les animaux, l’auteur nous propose, dans ce nouvel ouvrage, “Goûts et couleurs du monde”, de cheminer avec lui dans le monde des tannins. Ces molécules font les goûts et les couleurs du monde, mais qui saurait dire qui sont les tannins et comment ils agissent ?

En chatouillant l’observation et en excitant le plaisir de la mener, cet ouvrage est un rappel aux plaisirs sensoriels et à la façon dont nos sens nous aident à comprendre notre environnement. Marc-André Selosse, Professeur au Museum national d’Histoire Naturelle, enseigne dans plusieurs universités de France et à l’étranger.

Ce mois-ci, vous découvrirez :

  • Les différents lieux de formations
  • L’école de l’ADN et la formation CRISPR/Cas 9

Les formations s’inscrivent dans le cadre de la formation professionnelle continue. Notre Centre de Formation est enregistré et référencé au DATADOCK. Découvrez toutes nos formations dans le calendrier 2020 mis à jour sur notre site internet ou en écrivant à formation.fr@vwr.com. “

Manuel Ferreira,
Responsable du Centre de Formation Clients Avantor Services
Tél : 01 45 14 85 63
E-mail : formation.fr@vwr.com

L’actualité de Février

1. Informations utiles

Savez-vous que vous pouvez suivre nos Formations également en Province ?

Le Centre de Formation d’Avantor Services propose des formations au siège à Fontenay-sous-bois (94) en région parisienne mais également en Province : Nîmes, Orléans, Avignon, Lyon, etc.

Si vous ne pouvez pas vous déplacer, nous pouvons venir au sein de votre entreprise pour une formation disponible dans le catalogue ou spécialement créée pour répondre à vos besoins. Contactez-nous.

Recevez le catalogue

2. Focus sur une formation

Connaissez-vous la nouvelle formation “Validation pratique de votre système CRISPR/Cas 9 “?

Objet de la formation :

Cette journée de pratique à la paillasse vous donne clé en main une procédure complète de validation de votre système CRISPR-Cas avant de passer sur votre système cellulaire. Sur cette journée, il vous est montré par l’expérimentation comment valider vos guides destinés à votre stratégie de génome  editing par CRISPR/Cas quel que soit votre système cellulaire.

Public concerné : Tout public qui souhaite appliquer la technique
Méthodes pédagogiques : 85% de travaux pratiques et 15 % d’enseignement

Durée : 1 jour

Prochaines séances :

  • le 25 Mars 2020 à l’école de l’ADN de Nîmes
  • le 7 octobre 2020 à VWR International, Fontenay-sous-bois

Intervenants : Pr Christian SIATKA

L’École de l’ADN de Nîmes est inspirée d’un concept le « DNA Learning Center » initié par le Cold Spring Harbor Laboratory qui est une institution de recherche internationale New-Yorkaise dont le but est de promouvoir la recherche en biologie moléculaire et génétique à l’échelle internationale.

Depuis sa création en France à la fin des années 90, l’école de l’ADN, a développé 11 structures qui se sont fédérées autour de la Fédération francophone des Écoles de l’ADN présidée par la structure Nîmoise.

L’École de l’ADN pilote un « Centre d’Innovation sur les Sciences de la Vie » dont les principales disciplines sont la biologie, la génétique, la microbiologie, la phylogénie.

Sa mission principale consiste en la conception, la réalisation et la présentation d’ateliers scientifiques de haut niveau technologique à destination du plus large public.
Je suis intéressé(e)

VWR INTERNATIONAL SAS
VWR International SAS
Le Périgares – Bât B
201 rue Carnot
94126 Fontenay-sous-Bois cedex
Téléphone : 01 45 14 85 00
Email : info.fr@vwr.com
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