SCITREX en Occitanie

 

Ce programme de Culture Scientifique Technique et industrielle est réalisé avec la collaboration de la région Occitanie et couvre tout le territoire de la Région

SCITREX : SCIENCES TRANVERSALES EXPERIMENTALES EN OCCITANIE

C’est un programme de culture scientifique transdisciplinaire à destination des élèves de collège et lycée qui vise à valoriser

  • L’Innovation                                                                             
  • Les Sciences
  • La transdisciplinarité

 

 

 

 

 

 

 

Bio-informatique appliquée: analyses de séquences NGS avec Galaxy

Si vous souhaitez approfondir vos connaissances sur le traitement des données issues des NGS ( Next Generation Sequencing ), nous vous proposons une séance de découvertes des traitements des données bio-informatiques associées sur Galaxy

https://usegalaxy.org   et   https://galaxyproject.org

Les études de cas sont disponibles sur notre site sous l’onglet “documents en ligne”

NGS training 2019

NGS Workshop RNAseq

copier ces données et suivre ces instructions sous Galaxy

  • Open the Galaxy Upload Manager
  • Click the tab Rule-based
    • “Upload data as”: Collection(s)
    • “Load tabular data from”: Pasted Table
  • Paste the table from the grey box above. (You should now see below)
  • Click Build
SampleID	Group	URL
MCL1-DL	basallactate	https://ndownloader.figshare.com/files/5053573?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-DK	basallactate	https://ndownloader.figshare.com/files/5053570?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-DJ	basalpregnant	https://ndownloader.figshare.com/files/5053567?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-DI	basalpregnant	https://ndownloader.figshare.com/files/5053564?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-DH	basalvirgin	https://ndownloader.figshare.com/files/5053561?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-DG	basalvirgin	https://ndownloader.figshare.com/files/5053558?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-LF	luminalvirgin	https://ndownloader.figshare.com/files/5053555?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-LE	luminalvirgin	https://ndownloader.figshare.com/files/5053588?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-LD	luminalpregnant	https://ndownloader.figshare.com/files/5053579?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-LC	luminalpregnant	https://ndownloader.figshare.com/files/5053582?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-LB	luminalvirgin	https://ndownloader.figshare.com/files/5053585?private_link=f5d63d8c265a05618137
MCL1-LA	luminalvirgin	https://ndownloader.figshare.com/files/5053552?private_link=f5d63d8c265a05618137

2019 : Une année d’anniversaire pour les sciences naturelles !

2019 : Une année d’anniversaire pour les sciences naturelles !

La nature, l’organisation des formes vivantes, ont fascinés l’Humanité depuis l’Antiquité Grecque. Le premier penseur grec à s’être penché sur la question de l’organisation des animaux, de leur classification, est Aristote, notamment au travers de trois de ses écrits fondamentaux : « Histoire des animaux » (343 av. J.-C.) ; « Les parties des Animaux » (entre 343 et 330 av. J.-C.) et, « De la génération des animaux » (~330 av. J.-C.). Ces œuvres marquent le commencement de la longue histoire d’une discipline à part entière : Les sciences naturelles.

Les sciences naturelles se définissent comme « l’étude de la vie sur la Terre et de sa biodiversité » (1), pouvant se traduire également sous la formulation suivante : « ensemble formé par les sciences de la vie et celles de l’écosystème ayant permis l’éclosion de la vie » (2).

Pourquoi dire que 2019 est une année d’anniversaire pour les sciences naturelles ? Car celle-là marque une postérité importante évoquant des dates synonymes de tournants en matière de compréhensions, de connaissances en sciences naturelles et évolutives :

  • 160ièm anniversaire de la publication de l’ouvrage magistral du naturaliste anglais Charles DARWIN : «On the Origin of Species by Means of Natural Selection, or the Preservation of Favoured Races in the Struggle for Life » (1859), œuvre fondatrice du darwinisme.
Photo de la statue de Charles Darwin au Muséum d’Histoire Naturelle de Londres  (Darwin Center). ©S.SAUVAGERE.
  • 210ièm anniversaire de la publication, par le père de la conceptualisation du terme de biologie au sens contemporain du terme ; Jean-Baptiste Chevalier de LAMARCK : « La Philosophie Zoologique» (1809), dans laquelle il élaborera sa théorie du transformisme.
Monument à Lamarck au Jardin des Plantes du Muséum d’Histoire Naturelle de Paris réalisé par le sculpteur Léon Fagel (statue inaugurée le 13 Juin 1909). 
  • 230ièm anniversaire de l’achèvement d’une encyclopédie « naturelle » monumentale (36 volumes) du très grand naturaliste français ; Georges-Louis Leclerc Comte de Buffon : ” Histoire naturelle, générale et particulière, avec la description du Cabinet du Roy” (1789), œuvre illustrant la diversité du vivant avec des iconographies splendides.
Statue de Georges Louis Leclerc Comte de Buffon au Jardin des Plantes du Museum d’Histoire Naturelle de Paris réalisée par le sculpteur Jean Carlus (1883). © 2012 Pierre Thomas.

Le XXIème siècle est marqué par une crise biologique sans précédent. En effet, le déclin de la biodiversité actuel est sans appel, comme le prouve l’un des derniers calculs du « Living Planet Index » (« Index de Planète Vivante ») par le WWF (World Wide Fund for Nature), faisant acte d’une perte des  populations fauniques naturelles, à l’échelle planétaire, d’environ 60% entre 1970 et 2014 (3). A l’échelle du territoire nationale (DROM-COM compris), selon les dernières données de L’Observatoire National de la Biodiversité datant de fin 2018, 26% des espèces évaluées présentent un risque de disparition au niveau français (4).

Ainsi, il est du ressort de l’Humanité, pour la préservation de l’équilibre dynamique des écosystèmes et de sa propre survie, que de prendre en considération de façon urgente cette érosion massive de la biodiversité et de mettre en place les mesures qui s’imposent pour la préservation de la diversité du vivant. Prenons exemple sur ces grands naturalistes du XVIIIème et XIXème siècle pour lesquels la nature et les formes vivantes étaient avant tout un spectacle à observer et à comprendre ; Charles DARWIN l’illustre bien par cette citation : « The love for all living creatures is the most noble attribute of man ».

  • François Ramade. (2008), « Dictionnaire encyclopédique des sciences de la nature et de la biodiversité », Dunod, Paris.
  • Andler, D., Fagot-Largeault, A., & Saint-Sernin, B. (2002), « Philosophie des sciences », Gallimard, Paris, p.495.
  • 2018. Living Planet Report – 2018: Aiming Higher Grooten, M. and Almond, R.E.A. (Eds). WWF, Gland, Switzerland.
  • Moreau, S., Lévêque, A., Cerisier-Auger, A. (2018). «Biodiversité-Les Chiffres Clés-Edition 2018», Datalab n°48, Agence Française pour la Biodiversité (AFB), Observatoire National de la Biodiversité (ONB), Service de la donnée et des études Statistiques (SDES), Paris.

 

Stéphane Sauvagère

FETE DE LA SCIENCE 2017 en LOZERE

Le Collège de Sainte Enimie en Lozère a accueilli la fête de la science,

L’ecole de l’ADN toujours présente sur ces manifestations, a été invitée pour illustrer “la magie” de la bioluminescence. Stéphane a  animé des ateliers spécifiques afin de faire découvrir les mécanismes de bioluminescence chez les organismes vivants.Résultat de recherche d'images pour "comue montpellier"

Le reportage réalisé par le service de la COMUE de Montpellier illustre les actions menées au Collège de  Sainte Enimie

 

Vidéo de la FÊTE DE LA SCIENCE 2017 – LOZÈRE

 

Fête des jardins collectifs à Caveirac.

Fête des jardins collectifs

Communauté d'Agglomération Nîmes Métropole
Le samedi 20 mai s’est déroulée la très jolie fête des jardins collectifs dans le jardin partagé de Gérard à Caveirac.

L’association Abeille et Biodiversité a accueilli petits et grands afin de leur faire découvrir ce lieu d’échanges et de nature au travers de la visite du jardin et d’une initiation pratique au compostage.

Les enfants ont été fort bien occupés grâce aux associations “O’Rats Jeux Nids” et “Les Petits débrouillards” avec au programme : ludo-contes, concours créatif, ludothèque, ateliers de découvertes scientifiques…

Les visiteurs ont été initiés aux techniques d’utilisation des plantes (fabrication de teintures et eaux florales) par l’association “La Plante Infuse”.

A l’ombre du cerisier, la conférence animée par Mr Siatka, Directeur de “l’Ecole de l’ADN”, a captivé l’auditoire en rendant accessible les dernières découvertes scientifiques sur le biomimétisme.

La Raïma , salon de thé nomade, a apporté au jardin une touche d’exotisme et de dépaysement en proposant des boissons du monde sous sa tente berbère.

En soirée, les résidents du Foyer Hubert-Pascal “Terre d’Alice” ont présenté une pièce théâtrale sur les joies de la vie au jardin et la nécessité de préserver la biodiversité.

Le fabuliste “Pistil” a ravi l’assistance avec des rimes humoristiques sur la protection de l’environnement et les pouvoirs de la nature.

Pour clôturer cette journée nature, la “Trappe à sons” a accompagné les visiteurs jusqu’à la tombée de la nuit au son de la Bossa Nova.

L’Effet Gomasio  a proposé sur toute la journée de délicieux mets bio, sans gluten et végétariens.

Une très belle journée qui aura été l’occasion de découvrir les supers pouvoirs de la nature et l’intérêt de préserver la biodiversité, prendre le temps de se découvrir et d’en apprendre un peu plus sur la diversité qui nous entoure.

Formation Ark of Inquiry

Une fournée de formation au concept de Ark of inquiry

Le vendredi 7 avril 2017 à GénopolysL1080017 web

L’école de l’ADn en collaboration avec Gilles Guillon à Génopolys a réalisée une séance de formation Spécifique au concept de Ark of Inquiruy à des doctorants et des chercheurs.